血流感染是急性白血病（AL）粒缺伴发热患者最常见的感染，发病率高，且是导致AL患者感染死亡的重要原因之一。无法获得准确的感染病原菌诊断会导致患者接受不恰当的抗菌治疗甚至发生严重感染致死[1-2]。因传统微生物学检查识别病原微生物能力有限，临床上迫切需要对AL粒缺伴发热患者的微生物感染进行快速准确诊断的方法[3-4]。
近日，细胞生态海河实验室王建祥教授牵头的国内多中心团队在临床感染权威期刊《Clinical microbiology and infection》（IF=14.2）发表合作研究论文“Clinical metagenomic sequencing of plasma microbial Cell-free DNA for febrile neutropenia in acute leukemia patients” （细胞生态海河实验室为第一完成单位）。该研究从评估宏基因组二代测序（mNGS）检测的感染诊断性能以及对临床抗菌药物的干预效果两个方面解析了血浆mNGS对于感染诊断的价值。
该研究在442例AL粒缺伴发热患者的队列中评估了mNGS在单时间点诊断感染病原的效能。结果显示，mNGS在50.9%（225/442）的患者中发现了临床相关的感染性病原体，明显优于传统血培养阳性率21.3%（94/442）。
在mNGS检测阳性病例中，经临床专家小组评估在218例患者中确定了粒缺伴发热感染的致病性病原体，有81例（35.2%）患者参考mNGS结果进行调整用药，其中79例患者临床获益。
该研究表明了mNGS在AL粒缺伴发热患者感染病原诊断中的几个重要优势：1.mNGS可覆盖更广泛的微生物，尤其在检测真菌和病毒感染方面具有重要价值。2.血浆mNGS在一定程度上可作为局灶性疾病病原体诊断的非侵入性方法。3.抗生素使用对mNGS的影响较小，mNGS可作为接受过抗生素治疗患者病原诊断的有效工具。4.mNGS报告周期短，可促进早期调整抗菌药物治疗。5.对于抗感染治疗无效的AL粒缺发热感染患者，可根据mNGS结果调整抗菌用药。
综上，该研究证明了mNGS对AL粒缺伴发热患者感染病原诊断的重要价值，可促进更早期的恰当抗菌药物治疗，甚至降低AL粒缺发热严重感染患者死亡率。
细胞生态海河实验室王建祥教授为通讯作者。细胞生态海河实验室冯四洲教授、河南省肿瘤医院魏旭东主任医师及金匙基因科技有限公司饶冠华博士为共同第一作者。
参考文献：
1. 中华医学会血液学分会, 中国医师协会血液科医师分会. 中国中性粒细胞缺乏伴发热患者抗菌药物临床应用指南（2020年版） [J] . 中华血液学杂志, 2020, 41(12): 969-978. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0253-2727.2020.12.001.
2. Freifeld AG, Bow EJ, Sepkowitz KA, Boeckh MJ, Ito JI, Mullen CA, et al. Clinical practice guideline for the use of antimicrobial agents in neutropenic patients with cancer: 2010 Update by the Infectious Diseases Society of America. Clin Infect Dis. 2011 Feb 15;52(4):427-31.
3.Armstrong AE, Rossoff J, Hollemon D, Hong DK, Muller WJ, Chaudhury S. Cell-free DNA next-generation sequencing successfully detects infectious pathogens in pediatric oncology and hematopoietic stem cell transplant patients at risk for invasive fungal disease. Pediatr Blood Cancer. 2019 Jul;66(7):e27734.
4. Xu C, Chen X, Zhu G, Yi H, Chen S, Yu Y, Jiang E, Zheng Y, Zhang F, Wang J, Feng S. Utility of plasma cell-free DNA next-generation sequencing for diagnosis of infectious diseases in patients with hematological disorders. J Infect. 2023 Jan;86(1):14-23. doi: 10.1016/j.jinf.2022.11.020. Epub 2022 Dec 1. Erratum in: J Infect. 2023 Jan 16;: PMID: 36462587.
