脑机交互与人机共融海河实验室实行独立法人、实体运作，由天津市政府主导，天津大学牵头，联合中电云脑、海河产业基金等10余家优势单位共建而成。实验室实行理事会领导下的主任负责制，设立理事会、学术咨询委员会、研究研发及管理服务部门，涵盖多个基地及平台，网络覆盖范围广。
理事会是作为实验室运行管理的决策监督机构，负责审定实验室建设方案、制定和修改实验室章程、制定实验室发展目标及战略规划、审定年度工作计划及报告、审议批准实验室薪酬及管理运行等内部制度，总体协调领导实验室建设与发展。理事长单位由市教育委员会担任，副理事长单位由脑机交互与人机共融海河实验室、滨海新区人民政府、滨海高新区管委会、天津大学、中电云脑(天津)科技有限公司担任，理事会成员单位包括市科学技术局、市发展和改革委员会、市工业和信息化局、市财政局、市人力资源和社会保障局、市卫生健康委员会、市医疗保障局、市地方金融监督管理局、市药品监督管理局、市知识产权局、国家开发银行天津分行、海河产业基金有限公司、北洋海棠基金、天津天堰科技股份有限公司、九安医疗电子股份有限公司等企业。
